MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma marginale str. Dawn genome

Total Repeats: 22308

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_022760	AT	3	6	168068	168073	50 %	50 %	0 %	0 %	557237526
3002	NC_022760	CCT	2	6	168084	168089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557237526
3003	NC_022760	GGA	2	6	168260	168265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557237526
3004	NC_022760	CA	4	8	168287	168294	50 %	0 %	0 %	50 %	557237526
3005	NC_022760	CAA	2	6	168297	168302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557237526
3006	NC_022760	TG	3	6	168360	168365	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_022760	TTGCT	2	10	168389	168398	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3008	NC_022760	TGG	2	6	168434	168439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_022760	CT	3	6	168579	168584	0 %	50 %	0 %	50 %	557237527
3010	NC_022760	CTATC	2	10	168614	168623	20 %	40 %	0 %	40 %	557237527
3011	NC_022760	GC	3	6	168670	168675	0 %	0 %	50 %	50 %	557237527
3012	NC_022760	TGC	2	6	168838	168843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237527
3013	NC_022760	CTA	2	6	168932	168937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237527
3014	NC_022760	CAA	2	6	168940	168945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557237527
3015	NC_022760	TCAA	2	8	168964	168971	50 %	25 %	0 %	25 %	557237527
3016	NC_022760	CAA	2	6	168987	168992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557237527
3017	NC_022760	A	6	6	169044	169049	100 %	0 %	0 %	0 %	557237527
3018	NC_022760	TCA	2	6	169207	169212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	557237527
3019	NC_022760	A	7	7	169212	169218	100 %	0 %	0 %	0 %	557237527
3020	NC_022760	CTC	2	6	169219	169224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557237527
3021	NC_022760	GTAA	2	8	169395	169402	50 %	25 %	25 %	0 %	557237527
3022	NC_022760	CGC	2	6	169479	169484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557237527
3023	NC_022760	TCTG	2	8	169548	169555	0 %	50 %	25 %	25 %	557237527
3024	NC_022760	CCA	2	6	169613	169618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557237527
3025	NC_022760	GAG	2	6	169640	169645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557237527
3026	NC_022760	TA	3	6	169692	169697	50 %	50 %	0 %	0 %	557237527
3027	NC_022760	T	6	6	169816	169821	0 %	100 %	0 %	0 %	557237527
3028	NC_022760	TGC	2	6	169852	169857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237527
3029	NC_022760	CTC	2	6	169993	169998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557237527
3030	NC_022760	TAA	2	6	170021	170026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557237527
3031	NC_022760	TGG	2	6	170354	170359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557238165
3032	NC_022760	TAG	2	6	170384	170389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557238165
3033	NC_022760	TGG	2	6	170397	170402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557238165
3034	NC_022760	ATTA	2	8	170481	170488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_022760	ATGG	2	8	170522	170529	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_022760	TAA	2	6	170555	170560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_022760	ACTC	2	8	170570	170577	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3038	NC_022760	ATTT	2	8	170610	170617	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_022760	GTC	2	6	170622	170627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_022760	CAT	2	6	170628	170633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_022760	TGG	2	6	170756	170761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557237528
3042	NC_022760	GAT	2	6	170794	170799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237528
3043	NC_022760	GATCAA	2	12	170811	170822	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	557237528
3044	NC_022760	CCGT	2	8	170861	170868	0 %	25 %	25 %	50 %	557237528
3045	NC_022760	GAAG	2	8	170875	170882	50 %	0 %	50 %	0 %	557237528
3046	NC_022760	GTGGC	2	10	170938	170947	0 %	20 %	60 %	20 %	557237528
3047	NC_022760	GTC	2	6	170968	170973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237528
3048	NC_022760	TGG	2	6	171059	171064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557237528
3049	NC_022760	TAA	2	6	171203	171208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557237528
3050	NC_022760	GATG	2	8	171281	171288	25 %	25 %	50 %	0 %	557237528
3051	NC_022760	CGT	2	6	171293	171298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237528
3052	NC_022760	AGA	2	6	171329	171334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557237529
3053	NC_022760	CGT	2	6	171342	171347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237529
3054	NC_022760	T	7	7	171360	171366	0 %	100 %	0 %	0 %	557237529
3055	NC_022760	GTTG	2	8	171401	171408	0 %	50 %	50 %	0 %	557237529
3056	NC_022760	C	6	6	171509	171514	0 %	0 %	0 %	100 %	557237529
3057	NC_022760	ACTT	2	8	171540	171547	25 %	50 %	0 %	25 %	557237529
3058	NC_022760	CAA	2	6	171575	171580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557237529
3059	NC_022760	ACC	2	6	171598	171603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	557237529
3060	NC_022760	GTGA	2	8	171666	171673	25 %	25 %	50 %	0 %	557237529
3061	NC_022760	TCG	2	6	171783	171788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237529
3062	NC_022760	GCA	2	6	171824	171829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237529
3063	NC_022760	TGA	2	6	171836	171841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237529
3064	NC_022760	GTT	2	6	171866	171871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557237529
3065	NC_022760	AG	3	6	171978	171983	50 %	0 %	50 %	0 %	557237529
3066	NC_022760	AGG	2	6	172055	172060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557237529
3067	NC_022760	AG	3	6	172133	172138	50 %	0 %	50 %	0 %	557237529
3068	NC_022760	CTTGC	2	10	172213	172222	0 %	40 %	20 %	40 %	557237529
3069	NC_022760	GT	3	6	172253	172258	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_022760	GC	3	6	172281	172286	0 %	0 %	50 %	50 %	557238166
3071	NC_022760	G	6	6	172294	172299	0 %	0 %	100 %	0 %	557238166
3072	NC_022760	G	6	6	172311	172316	0 %	0 %	100 %	0 %	557238166
3073	NC_022760	CG	3	6	172337	172342	0 %	0 %	50 %	50 %	557238166
3074	NC_022760	TG	3	6	172372	172377	0 %	50 %	50 %	0 %	557238166
3075	NC_022760	GCGG	2	8	172410	172417	0 %	0 %	75 %	25 %	557237530
3076	NC_022760	AG	3	6	172420	172425	50 %	0 %	50 %	0 %	557237530
3077	NC_022760	AG	3	6	172479	172484	50 %	0 %	50 %	0 %	557237530
3078	NC_022760	GCAC	2	8	172597	172604	25 %	0 %	25 %	50 %	557237530
3079	NC_022760	GCA	2	6	172614	172619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237530
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3081	NC_022760	AGG	2	6	172726	172731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557237530
3082	NC_022760	CGTG	2	8	172760	172767	0 %	25 %	50 %	25 %	557237530
3083	NC_022760	CGA	2	6	172774	172779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	557237530
3084	NC_022760	T	6	6	172795	172800	0 %	100 %	0 %	0 %	557237530
3085	NC_022760	TC	3	6	172820	172825	0 %	50 %	0 %	50 %	557237530
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3087	NC_022760	GAT	2	6	172853	172858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237530
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3089	NC_022760	ATT	2	6	172931	172936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	557237530
3090	NC_022760	AT	3	6	173022	173027	50 %	50 %	0 %	0 %	557237530
3091	NC_022760	GCT	2	6	173129	173134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	557237530
3092	NC_022760	ACCC	2	8	173145	173152	25 %	0 %	0 %	75 %	557237530
3093	NC_022760	TGA	2	6	173255	173260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237530
3094	NC_022760	TGA	2	6	173279	173284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237530
3095	NC_022760	AGCCA	2	10	173311	173320	40 %	0 %	20 %	40 %	557237530
3096	NC_022760	CG	3	6	173344	173349	0 %	0 %	50 %	50 %	557237530
3097	NC_022760	GGT	2	6	173412	173417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	557237531
3098	NC_022760	TTG	2	6	173420	173425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557237531
3099	NC_022760	CTC	2	6	173475	173480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	557237531
3100	NC_022760	CAA	2	6	173580	173585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	557237531
3101	NC_022760	ACGC	2	8	173613	173620	25 %	0 %	25 %	50 %	557237531
3102	NC_022760	GAG	2	6	173622	173627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	557237531
3103	NC_022760	GAA	2	6	173710	173715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557237531
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3105	NC_022760	AAT	2	6	173757	173762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557237531
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3107	NC_022760	AAT	2	6	173872	173877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557237531
3108	NC_022760	G	6	6	173878	173883	0 %	0 %	100 %	0 %	557237531
3109	NC_022760	AAT	2	6	173977	173982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	557237531
3110	NC_022760	TCT	2	6	174022	174027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	557237531
3111	NC_022760	GTT	2	6	174049	174054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	557237531
3112	NC_022760	AAG	2	6	174085	174090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	557237531
3113	NC_022760	TGT	2	6	174163	174168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_022760	ATT	2	6	174200	174205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_022760	TG	3	6	174222	174227	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_022760	ATA	2	6	174250	174255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_022760	GT	3	6	174273	174278	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_022760	GA	3	6	174326	174331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_022760	GAT	2	6	174388	174393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_022760	ATG	2	6	174461	174466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_022760	GCTT	2	8	174483	174490	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3122	NC_022760	TGT	2	6	174507	174512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_022760	AGATAT	2	12	174574	174585	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_022760	CCTG	2	8	174591	174598	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3125	NC_022760	TA	3	6	174667	174672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_022760	N	228	228	174673	174900	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_022760	TGT	2	6	175029	175034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3143	NC_022760	CAT	2	6	175982	175987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3152	NC_022760	N	179	179	176442	176620	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3156	NC_022760	N	7	7	176752	176758	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3157	NC_022760	AG	3	6	176786	176791	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3158	NC_022760	TGG	2	6	176795	176800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3250	NC_022760	A	7	7	182955	182961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3251	NC_022760	GCA	2	6	182976	182981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3253	NC_022760	CTG	2	6	183083	183088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3255	NC_022760	GTT	2	6	183226	183231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3496	NC_022760	CTC	2	6	194770	194775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3497	NC_022760	TGA	2	6	194838	194843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	557237545
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3499	NC_022760	GCC	2	6	195154	195159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	557237545
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